结肠癌中CDH2、LEP、POSTN、TIMP1和VEGFC表达水平与5-FU敏感性的研究

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目的结肠癌的化疗耐药严重影响了患者的生存预后,临床上缺乏提示化疗耐药的标志物。本文利用生物信息学分析探讨了基因表达与氟尿嘧啶(5-FU)敏感性之间的关系,为进一步研究提供理论基础。方法本研究通过数据挖掘,筛选了与癌症复发和化疗耐药相关的基因。采用免疫组化(IHC)方法检测人结肠癌组织中的蛋白表达,采用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测患者样本和结肠癌细胞中的基因mRNA表达,采用CCK-8法检测结肠癌细胞系(HCT116和LoVo)对氟尿嘧啶的细胞毒性,采用碘化丙啶(PI)染色法检测细胞死亡。结果在本研究中,通过在GenCLiP3网站上使用“癌症复发”和“化疗耐药”两个关键词挖掘到了 602个基因。采用DAVID(Database for annotation,Visualization,and Integrated Discovery)6.8 版本,进行基因功能注释。通过序列分析富集了 602个基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,获得4个强相互作用的子集。在GEPIA数据库中,进一步发现在结肠癌中上调的14个基因(ATM、CDH2、CDKN2A、EPO、LEP、TGFB1、TIMP1、PGR、VEGFC、POSTN、BCL6、CYP19A1、NOTCH3、XPA)与结肠癌患者的不良预后相关。在33对配对的人结肠癌组织中检测到 8 个基因(ATM、CDH2、CDKN2A、LEP、PGR、TIMP1、POSTN、VEGFC)显著上调,这与数据库的结果一致,其中5个基因(CDH2、LEP、POSTN、TIMP1、VEGFC)与患者预后相关。使用小干扰RNA(siRNA)分别沉默这5个基因可显著提高结肠癌细胞对化疗药物氟尿嘧啶的敏感性。结论研究结果表明,CDH2、LEP、POSTN、TIMP1和VEGFC基因的表达可调节结肠癌细胞对氟尿嘧啶的化疗敏感性,是克服结肠癌氟尿嘧啶耐药的潜在靶点,是结肠癌化疗耐药的潜在标志物。
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