基于iTRAQ技术的牦牛体外成熟卵母细胞差异蛋白质组学研究

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体外受精、胚胎移植及体细胞核移植等现代生物繁殖技术能够推动优良牦牛资源快速扩繁,而卵母细胞体外成熟培养是现代繁殖生物技术的基础及关键环节,且MⅡ期卵母细胞的质量直接影响了卵母细胞的受精及后续受精卵卵裂。因此,鉴定和研究牦牛卵母细胞蛋白组学对于我们认识牦牛早期胚胎的发育过程具有十分重要的意义。本研究选用牦牛GV期、MⅡ期卵母细胞作为研究材料,提取样本蛋白质,应用iTRAQ结合LC-ESI-MSMS定量蛋白质组学技术对牦牛卵母细胞蛋白质组进行鉴定,同时筛选出GV、MⅡ期差异表达蛋白,并探究这些蛋白在牦牛卵母细胞体外成熟过程中所起的作用。结果如下:1、本试验利用Mascot 2.3.02软件对TripleTOF 5600 LC-MSMS系统获得的二级质谱图信息进行分析,共鉴定到1188种蛋白质,其中1067种可用于定量分析,这些蛋白质主要涉及蛋白翻译后修饰、转换、分子伴侣及一般功能预测等方面;2、依据蛋白质丰度水平,选择表达量差异1.2倍以上且经统计检验其P值小于0.05的作为显著差异蛋白,卵母细胞GV期与MⅡ期共有差异蛋白161种,其中81种表达上调,80种表达下调;3、生物信息学GO富集性分析表明差异蛋白主要富集于生物过程、细胞组分及分子功能3大类别。KEGG pathway注释结果表明本试验共有145种差异蛋白得到了注释,共涉及162条通路,包括细胞代谢调节相关通路、细胞免疫调节有关通路、Wnt信号途径及MAPK信号途径等,这些通路可能在调节卵母细胞生长发育方面具有重要作用。4、差异表达蛋白与转录组关联分析结果显示,GV期、MⅡ期卵母细胞共有1133种蛋白质与转录组相关联,其中包括63种GV-MⅡ期差异表达蛋白。此外,关联分析结果还发现,GV期与MⅡ期之间有7种差异蛋白和与之对应的基因在表达趋势上高度统一。但差异蛋白的丰度与对应mRNA的表达不存在线性关系。本研究首次对牦牛卵母细胞蛋白质组及GV-MⅡ期差异进行了表达蛋白分析,获得了牦牛卵母细胞蛋白质组的全景式认识,为牦牛卵母细胞体外成熟培养以及其分子调控机制的认识奠定了很好的基础数据。
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