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传统乳制品是乳酸菌的天然栖息环境,为揭示干旱半荒漠地区传统乳制品中乳酸菌菌群结构,并分离保藏乳酸菌资源,以采自内蒙古包头北部地区和巴彦淖尔牧区的69份传统乳制品样品(酸牛奶、奶油、奶酪和鲜牛奶)为研究对象,运用纯培养技术和16S rRNA基因序列分析方法对样品中乳酸菌进行分离鉴定,同时采用实时荧光定量PCR (q-PCR)技术对样品中优势菌群数量进行了比较分析,结果显示：利用纯培养技术从两个地区69份样品中分离获得202株乳酸菌,并运用16SrRNA基因序列分析方法将分离株鉴定为4个属16个种和亚种。分离白包头地区34份样品中的78株乳酸菌分别属于12个种和亚种,即Lac. lactis subsp. lactis(18株,占分离株23.08%)、Leu. mesenteroides(18株,占23.08%)、L. plantarum(14株,占17.95%)、Leu. pseudomesenteroide(8株,占10.26%)、L. helveticus(6株,占7.69%)、L. kefiranofaciens(5株,占6.41%)、L. paracasei(3株,占3.85%)、E. faecium(2株,占2.56%)和E. faecali、E. durans、L. buchneri、 Leu. lactis各1株(分别占1.28%)。其中以Lac. lactis subsp. lactis和Leu. mesenteroides为优势菌群。分离自巴彦淖尔地区35份样品中的124株乳酸菌分别属于12个种和亚种,即Lac. lactis subsp. lactis(48株,占分离株38.71%)、L. plantarum(32株,占25.81%)、Leu. mesenteroides(22株,占17.74%)、L. paracasei(6株,占4.84%)、L. helveticus(5株,占4.03%)、L. rhamnosus(3株,占2.42%)和L. brevis、L. diolivorans各2株(分别占1.61%),且Leu. pseudomesenteroide、E. durans、E. sulfurous、L. buchneri各1株(分别占0.81%)。其中以Lac. lactis subsp. lactis和L. plantarum为优势菌群。应用q-PCR技术分析比较样品中优势菌群的数量发现,包头地区酸牛奶和奶油中Lac. lactis subsp. lactis、L. plantarum数量显著高于奶酪的(p<0.05),酸牛奶中Leu. mesenteroides数量显著高于奶油和奶酪的(p<0.05)；巴彦淖尔地区酸牛奶和奶油中Leu. mesenteroides、L. plantarum数量显著高于奶酪的(p<0.05),酸牛奶中Lac. lactis subsp. lactis的数量显著高于奶油和奶酪的(p<0.05)；两个地区不同样品中各优势菌群的数量关系均为Lac. lactis subsp. lactis> L. plantarum> Leu. mesenteroides。该项研究中由于包头和巴彦淖尔地区地理距离较近,气候和地理环境相似,牧民生活习惯相近,传统乳制品的制作工艺相同,故这两个地区传统乳制品中分离到的乳酸菌菌种和优势菌群相近,但不同样品中优势菌群的数量存在显著差异(p<0.05)。