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目的
鉴定1例婴儿型Sandhoff病患儿HEXB基因的致病突变。
方法提取患儿外周血样DNA,应用PCR技术扩增其HEXB基因,并对PCR扩增产物进行直接测序,参考SNP数据库及ESP数据库进行比对。应用PubMed Protein BLAST系统分析HEXB基因编码的氨基已糖苷酶(Hex)的β亚基突变氨基酸的跨种属保守性;用PubMed BLAST CD-search系统分析Hex蛋白β亚基结构缺失所丧失的蛋白功能域;用PolyPhen-2、Mutation Taster及SIFT软件对新突变进行功能预测;通过全外显子基因组测序明确患儿有无其他可疑突变。
结果患儿携带HEXB基因c.1652G>A(p. Cys551Tyr)和c.1389C>G(p. Tyr463*)复合杂合突变。c.1389C>G(p. Tyr463*)在SNP数据库中收录,经PubMed BLAST CD-search系统分析其编码的Hex蛋白β亚基结构存在2个关键的蛋白功能域的丧失,预测为可能有害突变;c.1652G>A(p. Cys551Tyr)在SNP数据库及ESP数据库中均无收录,为未报道过的新突变,经PolyPhen-2、Mutation Taster及SIFT预测软件预测为可能有害突变。经全外显子基因组测序明确患儿除存在上述HEXB基因突变外不存在其他致病突变。
结论HEXB基因c.1652G>A(p. Cys551Tyr)和c.1389C>G(p. Tyr463*)复合杂合突变可能为该患儿的致病原因。基因突变检测可以为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。