基于蛋白质相互作用网络探索慢性粒细胞白血病相关分子复合物生物学通路

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目的

在蛋白质相互作用网络的基础上研究慢性粒细胞白血病,进一步深入了解其发生、发展机制。

方法

从在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)中筛选慢性粒细胞白血病遗传相关基因,应用Cytoscape软件和插件Agilent Literature Search进行文本挖掘并建立慢性粒细胞白血病的蛋白质相互作用网络。应用插件Clusterviz分析作用网络中可能包含的分子复合物。基于DAVID富集分子复合物的生物学通路。

结果

OMIM中慢性粒细胞白血病遗传相关基因有79个。相关蛋白质相互作用网络包含638个节点(蛋白质)、1 830条边(相互作用关系),可能包含5个分子复合物。

结论

分子复合物1涉及细胞因子与炎症反应、受体相互作用及细胞因子受体信号转导等生物学通路。通过对分子复合物3的分析显示出慢性粒细胞白血病有复杂的生物学行为,与其他肿瘤有广泛的相关性,为进一步阐释慢性粒细胞白血病发生、发展的机制提供了生物信息学基础。

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