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目的
在蛋白质相互作用网络的基础上研究慢性粒细胞白血病,进一步深入了解其发生、发展机制。
方法从在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)中筛选慢性粒细胞白血病遗传相关基因,应用Cytoscape软件和插件Agilent Literature Search进行文本挖掘并建立慢性粒细胞白血病的蛋白质相互作用网络。应用插件Clusterviz分析作用网络中可能包含的分子复合物。基于DAVID富集分子复合物的生物学通路。
结果OMIM中慢性粒细胞白血病遗传相关基因有79个。相关蛋白质相互作用网络包含638个节点(蛋白质)、1 830条边(相互作用关系),可能包含5个分子复合物。
结论分子复合物1涉及细胞因子与炎症反应、受体相互作用及细胞因子受体信号转导等生物学通路。通过对分子复合物3的分析显示出慢性粒细胞白血病有复杂的生物学行为,与其他肿瘤有广泛的相关性,为进一步阐释慢性粒细胞白血病发生、发展的机制提供了生物信息学基础。