二级结构预测相关论文
生物信息学中,后基因组时代的任务是了解基因表达的功能图谱,由于生物功能的主要体现者是蛋白质,因此研究蛋白质的功能就成为后基......
在后基因组时代,由于生物信息学的快速发展,生物信息数据呈指数级增长,生物信息数据库系统中的数据日益庞大,这为某一专业领域的研......
目的探讨人类巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)UL144序列在临床患儿低传代分离株中的多态性及其与临床疾病的关系. 方法对......
目的 研究人巨细胞病毒(HCMV)UL142基因在低传代分离株中的多态性,探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系.方法 27株......
目的 (1)研究线粒体(mtDNA)16SrRNA基因(T3200C、C3206T)和ND1基因(A4136G、A4164G和T4216C)突变在湖北汉族2型糖尿病人群中的发生......
膜蛋白大约占活性生物中已发现的蛋白质总数的30%,它在活性生物中的巨大作用可见一斑。膜蛋白已知的功能包括细胞间通信、调节细胞......
该论文以5-烯醇式丙酮酸-3-磷酸莽草酸合酶(5-Enolpyruvylshikimate-3-phosp-hate Syntheses简称EPSP合酶)为研究对象,以克隆新的E......
Ⅰ型鸭病毒性肝炎是由Ⅰ型鸭病毒性肝炎病毒( duck hepatitis virus serotype I, DHV-I)引起的雏鸭的一种急性高度致死性传染病,主......
采用RT-PCR和RACE技术相结合的方法,从石蒜花瓣中克隆到1个黄烷酮3–羟化酶(F3H)基因的cDNA全长序列,全长1293bp,包含1098bp的完整......
随着基因组计划的实施,特别是人类基因组计划的完成,核酸序列和氨基酸序列飞速增长,生物信息学成为后基因组特别是蛋白质组研究中最重......
蛋白质空间结构研究已成为后基因组时代生命科学领域的研究热点之一。目前,通过生物学实验方法测得结构的蛋白质只有4万多个,远远落......
近年来的研究表明,金属离子尤其是铜、铁等过渡金属离子的异常代谢与阿尔茨海默氏病、朊病毒疾病等神经退行性疾病有关。而金属离子......
miRNAs(MicroRNAs)约22nt的小非编码RNA在不同的动物和植物中被发现。研究发现它与基因表达、细胞周期调控及个体发育过程都有关系......
牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews.)为芍药科(Paeoniaceae)芍药属(Paeonia L.)牡丹组(Sect.Moutan DC.)落叶灌木,其花大色艳、芳......
从蛋白质的一级序列得到其对应的三维结构是目前生物信息学领域重要的课题之一。计算机预测方法被广泛应用于蛋白质二级结构的研究......
分子结构决定分子的性质和功能,RNA的各种功能与其结构紧密相连,为进一步挖掘其功能,必须从了解RNA的结构入手。然而,用实验方法来......
GPAT9基因是参与植物体中油脂代谢的重要基因之一,在甘蓝型油菜中该基因还未被深入研究。为了研究甘蓝型油菜中GPAT9基因,通过查找......
目的研究湖北地区2型糖尿病(type2diabetes mellitus,T2DM)中线粒体基因突变的发生率及其相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片......
随着蛋白质序列-结构分析中使用的机器学习算法越来越复杂,其结果的解释和发现过程也随之复杂化,因此有必要寻找简单且理论上可靠......
使用一种新的概率图模型——条件随机场对蛋白质二级结构进行预测,并给出了模型的构建、训练以及解码的算法。应用这一模型对一个......
猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因组5'非翻译区(untranslated region,UTR)对病......
针对蛋白质二级结构机器学习预测方法,忽略氨基酸疏水性特征以及氨基酸之间的长程作用和准确率不高的现状,进行了比较实验分析。采......
采用一种信息离散性度量方法对CB396数据集中的蛋白质数据进行二级结构预测,预测准确率达到72.1%.为了提高预测准确率,将FDOD算法结合PS......
动态规划是RNA二级结构预测最主要的算法,文中提出一种对动态规划矩阵采用分块技术的细粒度并行算法,通过对数据依赖关系的分析,引入......
基于随机上下文无关文法(SCFG)理论模型进行RNA二级结构预测是目前采用计算方法研究RNA二级结构的一种重要途径.由于基于SCFG模型的标......
目的 研究线粒体DNA(mtDNA)16S rRNA基因(T3200C、C3206T)和ND1基因(A4136G、A4164G和T4216C)突变在湖北汉族2型糖尿病人群中的发生率及......
研究微囊藻毒素聚酮合成酶、节球藻毒素聚酮合成酶之间的遗传关联性,并对其二级结构进行预测分析.应用聚合酶链反应得到2株蓝绿藻的......
p53作为关键肿瘤抑制蛋白参与了50%以上肿瘤的发生,本文对p53基本特性进行了初步地分析,通过分析p53氨基酸组成、疏水性表明p53蛋......
对于基于茎区组合的RNA二级结构预测算法的第一步是构建理论茎区集合,该集合的合理性和有效性将对预测算法的最终结果有直接影响本......
针对双向反馈神经网络(BRNN)的结构复杂、收敛速度慢的特点,本文提出了一种改进的BRNN网络.将BRNN左、右子网络的隐层删除,直接将......
针对多序列蛋白质二级结构预测问题,提出了一种基于训练集自动构造原型并自适应进行距离度量学习的大间隔多度量学习模型。该方法......
引入蛋白质二级结构预测的新方法:隐马尔可夫模型.其中将蛋白质的二级结构分成三类:H(指α-螺旋),E(β-折叠)及O(包括转角,卷曲及......
后基因组时代最主要的研究任务之一就是阐明蛋白质的功能。蛋白质功能可以帮助人们理解复杂的生命现象。但是在许多情况下,不仅要了......
为提高蛋白质二级结构预测精度,提出一种新的网络模型和编码方法。首先利用基因表达式编程(GEP)的全局搜索能力同时进化设计神经网络......
由于基于最小自由能模型的传统算法复杂度高且搜索效率低,故利用量子遗传算法提出了一种新的核糖核酸二级结构的预测算法.该算法将......
为检测3株温和气单胞菌中是否存在CRISPR,采用PCR方法扩增3株菌的CRISPR序列,并利用生物信息学方法分析和预测了重复序列(direct r......
猪水疱病(Swine vesicular disease,SVD)是猪的一种烈性传染病,其临床症状与猪口蹄疫难以区别,被世界动物卫生组织(OIE)列为A类传......
小麦高分子量麦谷蛋白亚基(high molecular weight glutenin,HMW-GS)是籽粒贮藏蛋白的重要组分。HMW-GS的组成和含量直接影响和决......
采用傅里叶红外光谱(FT-IR)的酰胺Ⅰ带和酰胺Ⅲ带测定绿色木霉产双功能壳聚糖酶-纤维素酶(CCBEs)的天然二级构象,结果显示:FT-IR光......
蛋白质序列的不同特征提取方式对蛋白质结构分类有很大的影响。为更好地表达蛋白质结构信息,基于特征融合思想构建特征向量,并使用......
ε-聚赖氨酸(ε-Poly-L-Lysine)是由微生物发酵合成的一种由赖氨酸单体通过ε-酰胺键形成的多肽。ε-PL具有优良的抑菌作用,对革兰氏......
为提高蛋白质二级结构预测的精度,提出了一个由5个子网络集成的多模神经网络模型,预测结果由5个子网络综合得到。对于每个子网络采......
随着人类基因组计划的完成,生命科学的研究重点逐步的从基因组学转向蛋白质组学,人类进入后基因组时代。蛋白质组学的研究重点是蛋......
【目的】了解云南省马铃薯纺锤块茎类病毒分子变异情况及其致病机制。【方法】以采自云南2个不同地方疑似马铃薯纺锤块茎类病毒病......