泛基因组相关论文
小麦条锈病是由小麦条锈菌引起的一种小麦真菌病害,在全球小麦种植区均有发生,我国每年都会受到小麦条锈病的危害,造成约400万吨小......
支原体(Mycoplasma)是一种无细胞壁的原核生物,专性细胞内寄生,呈现多样的生态位。部分支原体有一定的致病性,给不同行业造成巨大损......
由副猪嗜血杆菌(Glaesserella parasuis)引起的以纤维性多发性浆膜炎和关节炎为特征的格拉泽氏病(Gl?sser’s disease)是世界养猪业现......
由条形柄锈菌小麦专化型(Puccinia striiformis f.sp.tritici,Pst)引起的小麦条锈病是小麦上的一种重要真菌病害,严重威胁我国乃至全......
麦类作物主要包括普通小麦、大麦、黑麦、燕麦及小黑麦等物种,伴随着人类文明超过一万年,作为主粮以及能源物质,在人类生活中扮演着不......
微生物是生物地球化学循环中不可缺少的组成部分,在平衡生态系统、调节动植物新陈代谢、预防疾病等方面具有重要功能。测序技术的......
致病菌流行使全球承受巨大的健康和经济负担,是目前亟需关注和解决的公共卫生问题。其中,鲍曼不动杆菌、艰难梭菌和粪肠球菌是常见......
目的 运用生物信息学方法分析构建E2F1对微RNA(miRNA)的转录调控进而影响下游靶基因mRNA的转录因子网络,从而探讨E2F1通过miRNA参......
铜绿假单胞菌是一种常见的烃类降解菌,在环境污染治理中具有广阔的应用前景.利用泛基因组对10株铜绿假单胞菌进行分析以深入了解其......
[目的]为了探究短杆菌属对海洋环境的适应机制.[方法]本研究通过对6株分离自不同洋区、属于不同分类单元的短杆菌菌株进行测序、拼......
驯化是迄今为止人类进行的时间最久、规模最大的遗传学实验,针对从野生到家养动物的遗传基础的详细解析将有助于检验已有的遗传学......
假单胞菌属在各种环境广泛分布且具有重要的生态应用价值,然而当前研究对其环境适应性遗传基础的解析尚不充分.选择33株有效发表且......
最早从细菌研究中提出的泛基因组(Pan-genome)包括了核心基因组、特有基因组、非必须基因组3部分,由美国科学家Herve Tettel等于20......
随着三代测序组装的高质量参考基因组的陆续发布,以及大规模重测序和群体遗传学分析的广泛进行,研究人员发现来自单一个体的参考基......
参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,现代基因组学技术对植物遗传变异发掘等研究起推动作用。研究发现少数参考基因组不能完......
【目的】基因组结构变异(SV)和基因拷贝数变异(g CNV)是动植物中主要的遗传变异来源,全面准确地鉴定和分析SV和g CNV对挖掘优异等......
黄瓜(Cucumis sativus L.)是全球广泛种植的重要蔬菜作物,也是研究植物维管束生物学和性别决定的模式物种。前人基于群体基因组学......
相对于单个参考基因组仅聚焦于个体遗传信息的挖掘,泛基因组研究则能够反映整个物种或类群全部的遗传信息。随着基因组测序和分析技......
油菜是世界上第二重要的油料作物,水稻是最主要的粮食作物之一,虽然它们都已获得参考基因组,但是单个参考基因组不能表征作物种内......
参考基因组是现代功能基因组学的核心框架,以此为基础的现代基因组学技术在过去20年对植物遗传变异发掘、功能基因克隆等研究起了......
Arthrobacter aurescens TC1和Pseudomonas sp.ADP是目前莠去津降解菌的模式菌株,筛选出Microbacterium sp.HBT4,旨在挖掘这3株不......
苏云金芽胞杆菌Bacillus thuringiensis(Bt)作为微生物杀虫剂,被广泛应用于农业、林业和卫生害虫的防治;而利用Bt杀虫基因研制的转基......
最早在细菌中,由美国科学家Herve Tettel等,于2005年提出了泛基因组(Pan-genome)概念。泛基因组展示由核心基因组、特有基因组、非......
嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是人类和水产养殖中常见的病原体,存在于多种水环境、食品以及食品加工和储存系统中。该菌能......
整合性接合元件(ICE)是一种可自传递的移动遗传元件(MGE)。整合性接合元件常赋予宿主细菌新的性状,如耐药性和致病性等。目前,SXT/......
牦牛是我国青藏高原及其毗邻高山、亚高山等高寒地区特有的珍稀牛种,也是世界上生存于高海拔环境中的稀有家畜。牦牛经过长时间的......
随着下一代测序技术通量和速度的提高和成本的降低,可以快速地测定细菌的基因组,为基因组之间的比较提供丰富的信息材料,为深入研......
由担子菌甘蔗鞭黑粉菌(Sporisorium scitamineum,简称Ssc)引起的甘蔗黑穗病是我国甘蔗生产中最重要病害。Ssc的生活史分为无致病能......
随着DNA测序技术的发展,越来越多的物种基因组被测序,即使是在同一物种内,基因组也存在着较大差异.为了更全面的在基因组水平上探......
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们......
采用玻璃粉吸附法提取重金属污染土壤的泛基因组,利用细菌16SrDNA保守区段B2/B3为引物,经PCR扩增获得包含V8和V9两个高变区的大小......
细菌是自然界中最古老的生物种群之一,不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性,在表型特征上具有明显分化......
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为了对生防细菌绿针假单胞菌的基因组信息进行深入探索,全面描述绿针假单胞菌的特征并挖掘其次级代谢产物,从NCBI数据库中获得46个......
为进一步加深对凝结芽孢杆菌基因组的了解,同时探索其次级代谢通路。从NCBI数据库中获得33个凝结芽孢杆菌的基因组,利用泛基因组分......
非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)引起的一种猪烈性传染病,死亡率可高达100%。该病被世界动物卫生组织(O......
根瘤菌可以侵染豆科植物的根部形成根瘤,从而起始生物固氮过程。它们的互惠共生在生命的历史长河中起着非常重要的作用,但是对于它......
泛基因组指同一进化分支内所有个体携带的所有基因的集合,通过比较不同个体或群体之间基因组成的差异,对这一进化分支的演化进行研......
真核生物的基因组复杂性远远高于原核生物,其复杂性难以用基因组的大小、蛋白质编码基因的数量等来评估,但是,一个物种的基因组可......
1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)是植物合成乙烯的直接前体。ACC脱氨酶催化分解ACC生成α-酮丁酸和氨。有ACC脱氨酶的微生物能分解植物产......
目的:痤疮丙酸杆菌(C.acnes)是人体皮肤表面的主要共生菌,具有维持皮肤稳态和调节皮肤免疫系统的作用,同时,该菌被认为是寻常痤疮的......
猪链球菌(Streptococcus suis,SS)是一种重要的人畜共患病病原,可引起人和猪的败血症、关节炎、脑膜炎、心内膜炎等多种疾病,严重......
泛基因组(Pan-genome)是某一物种全部基因的总称,其中包括核心基因组(该物种所有个体中都存在的基因)和非必须基因组(只在部分个体......