基于网络药理学研究脾胃培源方治疗慢性萎缩性胃炎作用机制

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目的:本项研究运用网络药理学的相关技术与研究方法,探究脾胃培源方治疗慢性萎缩性胃炎可能的作用机制。方法:使用TCMSP、PubChem、Target Net与化源网数据库检索脾胃培源方的有效活性成分,利用Swiss Target Prediction进行作用靶点预测后,基于Uniprot数据库,将作用靶点基因进行人类基因的名称转换,并基于Cytoscape 3.7.2搭建单味药“活性成分-作用靶点”网络,通过String对单味药作用靶点进行分析,并将结果导入至Cytoscape 3.7.2搭建单味药蛋白互作网络。将脾胃培源方化合物与作用靶点整理后,使用Cytoscape 3.7.2搭建脾胃培源方“药物-化合物-靶点”网络。基于Gene Cards、OMIM、DisGeNET、HPO、Pharm GKB数据库检索慢性萎缩性胃炎疾病靶点,将预测的全方药物作用靶点与疾病靶点取交集获得交集基因,基于微生信在线绘图工具绘制韦恩图。将整合后的交集基因导入至String并分析,搭建蛋白互作网络。基于Metascape进行GO MF、BP、CC与KEGG通路富集分析,依据结果基于微生信在线绘图工具绘制相应的结果图,并运用Cytoscape 3.7.2构建“靶点-通路”网络。结果:脾胃培源方“药物-化合物-靶点”网络中共包含42个化合物、678个靶点,关键化合物为槲皮素、山奈酚、木樨草素等;PPI筛选后得到关键靶点主要有Akt1、TNF、IL6、TP53、VEGFA等。GO分析取各项前20位结果,生物过程包括细胞运动的正向调节、蛋白质磷酸化的正向调节、对无机物质的反应、对细胞因子的反应等;分子功能包括磷酸转移酶活性、细胞因子受体结合、激酶结合、转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合等;细胞组成包括膜筏、囊泡腔、细胞顶端部分、膜侧、转录调节复合物、细胞质核周区、转移酶复合物等;KEGG通路富集分析筛选得到206条通路,取P值较小的前20位,有癌症途径、PI3K/Akt信号通路、癌症中的蛋白聚糖、癌症中的MicroRNA、MAPK信号通路、细胞凋亡、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药等。结论:脾胃培源方可能是槲皮素、山奈酚、木樨草素、β-谷甾醇、异鼠李素等主要活性成分发挥其作用,介导癌症通路、PI3K/Akt等信号通路,参与正向调节细胞运动、正向调节蛋白质磷酸化、对无机物质的反应、对细胞因子的反应等生物进程来起到治疗慢性萎缩性胃炎的作用。
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