目的:采用非标记定量蛋白质组学技术检测初诊非小细胞肺癌与健康体检者血清中蛋白质的表达,对患者进行随访,筛选出差异蛋白,并进行生物信息学分析,寻找非小细胞肺癌早筛潜在的生物标志物,并为非小细胞肺癌早期的精准治疗方案选择提供参考依据。方法:选取我院入院患者中通过电子支气管镜或肺穿刺活检病理确诊为非小细胞肺癌初诊患者（未进行抗肿瘤治疗）6例,其中肺腺癌和肺鳞癌均为3例,收集血清作为实验组;并同期收集我院体检中心健康体检者血清6例作为对照组,对入组患者随访三个月,整理收集患者临床治疗方案及效果,采用毛细管高效液相色谱-质谱联用技术进行质谱分析得出质谱图,质谱图使用Proteome Discover 2.4软件进行查库和非标记定量分析,其中非小细胞肺癌与健康体检者、肺腺癌与肺鳞癌两组样本均值进行t检验和差异倍数（FC）计算,以P＜0.05且FC≤0.667视为差异蛋白表达量下调,FC≥1.5视为差异蛋白表达量上调。筛选出差异表达蛋白,利用GO和KEGG数据库进行生物信息学分析。根据随访结果,针对抗血管生成治疗后稳定病例2例的治疗前血清和非抗血管生成治疗后进展病例2例的治疗前血清,再次采用毛细管高效液相色谱-质谱联用技术进行质谱检测,使用Proteome Discover 2.4软件进行查库和非标记定量分析,并进行t检验和FC计算再次筛选差异蛋白,并利用GO和KEGG数据库进行生物信息学分析。结果:一、非小细胞肺癌差异蛋白的表达和功能在非小细胞肺癌中存在83个蛋白的显著差异表达,其中,44个蛋白表达上调,上调倍数最高的为细丝蛋白A;39个蛋白表达下调,下调倍数最高的为延胡索乙酸酯酶。这些差异表达蛋白涉及:细胞过程、生物调节、代谢过程、对刺激的反应、多细胞生物过程、信号、转移、生物粘附等生物学过程（BP）和分子结合过程、催化活性、分子功能调节、抗氧化过程等功能（MF）,以及参与细胞学组分（CC）的构成。其显著功能主要为:负调控DNA-结合转录因子活性、蛋白质结合、基因表达调控、NF的负调节-kappa B转录因子活性、肌动蛋白纤维聚合的负调控等。其主要与代谢途径、癌症中转录失调等KEGG通路有关。二、肺鳞癌和肺腺癌的差异蛋白表达和功能分析在肺腺癌和肺鳞癌之间的检测出13个差异蛋白,以肺腺癌作为对照标准,肺鳞癌7个蛋白表达上调,上调倍数最高的为骨髓蛋白多糖;5个蛋白表达下调,下调倍数最高的为超贝氏体。差异表达蛋白功能涉及细胞过程、位置化、对刺激的反应、生物调节、代谢过程、免疫系统过程等生物功能和结合过程、催化活性、分子功能调节等分子功能（MF）,以及参与细胞组分构成。其中具有显著性的功能主要是:上调蛋白中蛋白酪氨酸磷酸酶和受体型酪氨酸蛋白磷酸酶γ在蛋白酪氨酸磷酸酶活性、肽基-酪氨酸去磷酸化过程中发挥重要作用,而下调蛋白参与芳香化合物分解代谢过程、结合的调节、外源性凋亡信号通路的调控等。主要与代谢途径、癌症中转录失调、nod样受体信号通路等KEGG通路有关。三、治疗稳定组和治疗进展组的差异蛋白表达和功能分析相对于治疗进展组,治疗稳定组出现20个蛋白表达上调;10个蛋白表达下调。涉及细胞过程、生物调节、发展过程、对刺激的反应、代谢过程等生物学过程和结合过程、催化活性、分子功能调节、分子功能传导等分子功能（MF）,以及参与构成细胞解剖实体和蛋白复合物等。其中表达上调蛋白质血管内皮生长因子受体3（VEGFR-3）和表达下调蛋白质谷胱甘肽S-转移酶ω-1（片段）（GSTO1）在血管内皮生长因子信号通路、血管内皮生长因子-活化受体活性中发挥重要作用。谷胱甘肽S-转移酶ω-1（片段）在KEGG通路富集分析中作为差异下调蛋白质与铂耐药性、药物代谢-细胞色素P450、化学致癌、细胞色素P450对外源性物质的代谢、药物代谢-其他酶、谷胱甘肽代谢、癌症的途径、代谢途径等均有关。通过将非小细胞肺癌患者中筛选出来的83个差异蛋白与治疗稳定组中筛选出来的30个蛋白进行交集分析,得到了一个共有的差异表达蛋白:表达上调的色素上皮衍生因子。结论:1.非小细胞肺癌差异表达蛋白质的显著富集功能表现为负调控DNA-结合转录因子活性、蛋白质结合、基因表达调控、NF的负调节-kappa B转录因子活性、肌动蛋白纤维聚合的负调控等。主要与代谢途径、癌症中转录失调等KEGG通路有关。2.肺鳞癌和肺腺癌之间的差异蛋白中蛋白酪氨酸磷酸酶和受体型酪氨酸蛋白磷酸酶γ参与蛋白酪氨酸磷酸酶活性、肽基-酪氨酸去磷酸化过程,部分蛋白参与芳香化合物分解代谢过程、结合的调节、外源性凋亡信号通路的调控等。主要与代谢途径、癌症中转录失调、nod样受体信号通路等KEGG通路有关。3.谷胱甘肽S-转移酶ω-1（片段）的下调和色素上皮衍生因子上调对抗血管生成治疗有效性的提示,可能为非小细胞肺癌的早期精准诊治具有一定意义。