目的：探讨宏基因病原微生物二代测序对不明原因肺部感染患者的诊断价值。
　　方法：通过回顾性分析温州医科大学第一附属医院呼吸与重症医学科2018年5月至2019年2月期间因不明原因肺部感染收入住院，并行宏基因二代测序检查的患者，收集上述住院患者的临床资料，分析宏基因二代测序对不明原因肺部感染诊断的阳性率，特异率等，分析其对不明原因肺部感染的诊断价值。将54例患者的宏基因检验数据与传统检验数据分为2组，采用卡方检验,对比两组间的阳性率与特异率。
　　结果：1.共收集54位不明原因肺部感染患者，13例入住呼吸重症监护病房，其余41例入住呼吸科普通病房。男性35例，女性19例，年龄（19～83）岁，平均（58.94±15.17）岁。
　　2.送检标本类型为肺穿刺组织14例，肺泡灌洗液24例，外周血4例，淋巴结穿刺组织4例，胸腔积液2例，痰液4例，气管镜活检组织1例，脑脊液1例。
　　3.通过宏基因组学检测，54例患者中有49例取得了阳性结果，呈现阴性结果5例，最后有24例患者明确了具体感染病原体，阳性率为90.74%，特异率为44.44%.
　　4.通过传统病原学检查（包括培养，涂片等），54例患者中有21例取得了阳性结果，呈现阴性结果33例，最后有12例患者明确了具体感染病原体，阳性率为38.89%，特异率为22.22%。
　　5.将资料分为两组，分别为宏基因组与传统培养组，对两组间的阳性率与特异率分别进行比较分析，并采用卡方检验，P＜0.05，有统计学差异。
　　6.同时通过宏基因病原微生物二代测序发现了较多传统培养较难培养成功的病原体，如耶氏肺孢子菌、星座链球菌、诺卡菌等。在54例患者中，24例患者明确了具体感染病菌，其中6例肺孢子虫病；3例结核；2例肺曲霉菌病；6例为细菌性肺部感染，分别为星座链球菌、鲍曼不动杆菌2例、多噬伯克霍尔德菌、嗜麦芽窄食单胞菌、粪肠球菌；1例为腺病毒肺炎；1例奴卡菌感染；1例支原体肺炎；有3例患者诊断为脓胸或肺脓肿，1例同时检测到3种致病菌，考虑为多重菌感染，其余两例肺脓肿致病菌分别为金黄色葡萄球菌、放线菌；1例为支气管扩张，病原体为肺炎克雷伯菌。
　　结论：1.宏基因二代测序诊断效能明显高于传统检测方案，如培养、涂片、抗原抗体检测方案等。
　　2.同时对罕见、少见病原体有较高的检出率。