【摘 要】
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本文利用PCR方法扩增测序得到湾鳄（Crocodylus porosus）、非洲窄吻鳄（Crocodylus cataphractus）和骨喉鳄（Osteolaemus tetraspis）的线粒体基因组全序列,序列全长分别为16917 bp、16847 bp和16873 bp。鳄类mtDNA基因组成与其它脊椎动物相似,由22个tRNA,2个rRNA和13个蛋白编码基因及一个非编码的控制区（D-l
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本文利用PCR方法扩增测序得到湾鳄（Crocodylus porosus）、非洲窄吻鳄（Crocodylus cataphractus）和骨喉鳄（Osteolaemus tetraspis）的线粒体基因组全序列,序列全长分别为16917 bp、16847 bp和16873 bp。鳄类mtDNA基因组成与其它脊椎动物相似,由22个tRNA,2个rRNA和13个蛋白编码基因及一个非编码的控制区（D-loop）所组成。3种鳄的基因排列顺序与GenBank上已公布的鳄类全序列一致,但是与脊椎动物常见的线粒体基因排列顺序有所不同。在鳄类mtDNA中tRNAPhe转移到tRNAPro的3’端,同时tRNASer（AGY）和tRNAHis基因的位置发生了互换。基于线粒体全序列和线粒体控制区保守序列探讨鳄类系统发生,综合两者分析结果,本研究支持现存鳄目聚为两支,即鼍科和鳄科,建议将传统的食鱼鳄科食鱼鳄并入鳄科,并作为鳄科中的一个属,与假食鱼鳄属构成姐妹群关系。鳄科中非洲窄吻鳄应从鳄属中独立出来,重建长吻鳄属Mecistops。鳄科内的属间亲缘关系为（（食鱼鳄属+假食鱼鳄属）+（鳄属+（长吻鳄属+骨喉鳄属）））。根据线粒体全序列构建的系统树支长估计鳄类分歧时间,现存鳄类大约在145MYA开始分歧形成两大支系;大约在86MYA食鱼鳄属和假食鱼鳄属与鳄科的其它物种发生分歧;大约在53MYA第三纪早期长吻鳄属和骨喉鳄属的祖先与鳄属发生分歧。本文估计的鳄类分歧时间与一些分子数据基本一致,比化石证据略早。
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