与核DNA相比,线粒体DNA（mtDNA）具有母系遗传,无重组及突变率比较高的特性,因此被广泛的应用于生物系统发生学,比较基因组学,进化基因组学,种群遗传学和分子进化的研究。随着PCR技术以及long PCR实验技术的发展,基因组序列扩增和DNA测序技术的不断完善,动物线粒体基因组全序列的研究已成为分子系统学研究的热点之一。本文利用long PCR和分子克隆相结合的方法得到苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的线粒体基因组全序列。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶环状分子全长分别为15,245bp和15,267bp,都包括13个蛋白质编码基因（ATP6, ATP8,COI-III,ND1-6, ND4L, Cytb）、22个tRNA基因、2个rRNA基因（16S和12S）以及非编码的控制区;此外,苎麻珍蝶基因组D-loop区中多一个tRNAIle（AUR）b。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组基因排列顺序和方向与其他鳞翅目昆虫相一致,未出现基因重排或基因缺失现象。在苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组中,除COI外,其余的12个蛋白质编码基因都以ATN作为标准的起始密码子,COI基因没有标准的起始密码子ATN,而是以GCG（R）作为其起始密码子,以单个残基T终止,不完全终止密码子可能通过mRNA加工过程中的多聚腺苷酸化形成完整的终止密码子TAA;除tRNASer（AGN）缺少DHU臂而形成了一个简单的环外,其它tRNA都形成标准的三叶草结构;控制区都不含有明显的大片段重复结构,但存在一些微卫星样的结构,如（TA）n等以及polyA和polyT结构。为了探讨苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的系统分类地位,本研究基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因全序列,使用邻接法（neighbor-joining,NJ）构建了7种蝴蝶的NJ树,使用采用最大似然法（maximum-likelihood, ML）构建了ML树;又结合COI基因全序列构建了23种蛱蝶的NJ树和ML树。实验结果显示:珍蝶类应归入釉蛱蝶亚科珍蝶族;珍蝶族与釉蛱蝶族的亲缘关系较豹蛱蝶族近;绢蛱蝶科与螯蛱蝶科构成姊妹类群。