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将子窗口因子分析法(SWFA)应用于GC-MS联用检测数据分析，并以两种偶氮染料3,3′-二氯联苯胺和4,4′-次甲基-双-(2-氯苯胺)重叠图谱为例进行了解析。结果表明，此方法可直接进行目标组分的质谱分辨，得到目标组分的质谱图，进而得到该组分的色谱图。其结果准确、可靠。与窗口因子分析相比，子窗口的选择更加容易，人工干预少，解析速度快。