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转基因食品中外源基因的非预期效应可以引起转基因食品的营养成分含量发生变化,甚至产生一些新的毒性物质,是转基因植物食品安全性评价的重要内容之一.由于外源基因非预期效应的不可预见性,因此用常规的分析技术难以准确测定.利用蛋白质组定量分析技术和基因芯片技术从蛋白质组和mRNA水平上比较转基因植物食品和非转基因植物食品的基因表达差异,是检测外源基因非预期效应的有效手段.文中对利用蛋白质组分析技术和基因芯片技术检测转基因食品中外源基因非预期效应的应用进展进行了综述分析.