序列比对算法相关论文
近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,生物数据的存储与管理的规模在不断扩大,各种类型的生物数据成爆炸式增长,逐渐形成了“序列......
在生物学当中，BLAST序列比对算法是一个应用极为广泛的算法，它对海量DNA或蛋白质序列进行处理，具有数据密集和IO密集型特征，消耗时间通......
本文的主要工作是通过研究序列比对算法,实现一个cDNA/mRNA序列与DNA序列的跨物种比对软件XAT(cross-Alignment Tool)。本文主要借......
序列比对是生物信息研究的基础和前提。进行序列比对的目的之一是让人们能够判断序列之间是否具有足够的相似性,判定序列之间是否......
人类基因组计划(human genome projeet,HGP)是美国在1990年提出实施的一项伟大的科学计划，自那以后，人们已经获取了大量的DNA、RNA及......
近些年,下一代测序技术获得了突飞猛进的发展,由此产生了越来越多的测序数据。如何处理这些测试数据一直以来都是生物信息学领域的......
多序列比对是现代生物信息学研究领域非常重要的核心问题。为了能够比对多种相近物种之间的多条序列，我们迫切需要一种多序列比对工......
序列比对是一种通过排列基因组序列来识别序列相似性区域,从而获得待比对序列之间的功能、结构或进化关系的技术。随着人类基因组......
基因是承载着生命体特定遗传信息的核苷酸序列,当其产生突变或变异后就会导致各种癌症或遗传病的发生,因此治疗各种遗传病和癌症的......
该文在介绍了不同基因序列比对算法及其各自优缺点的基础上,针对Smith-Waterman算法着重分析了一些并行化方法,并结合集群式(Clust......
本研究提出了中心残基结构单元的概念，发展了基于中心残基结构单元的结构比对和序列比对算法，以及基于中心残基结构单元的残基从头设......
本文使用遗传算法解决多序列比对问题，并进一步研完了各种遗传算子在比对过程中所起的作用。对算法进行了改进。最后实现了一个多序......
随着二代测序平台的发展,二代测序技术可短时间产生数以千万计长度在100位点左右的测序片段数据（read）,如何快速、准确地将这些read......
Smith-Waterman算法是一种经典的序列比对算法,在双序列比对的情况下具有比较好的性能,但是在大规模的序列比对时,其性能并不能令......
在生物信息学中，蛋白质序列比对是最为重要的算法之一，生物技术的发展使得已知的序列库变得越来越庞大，这类算法本身又具有计算密集型......
Smith-Waterman算法是目前被使用最广泛的序列相似性比较算法之一，它适用于寻找局部相似序列对。该算法精确度较高，一直沿用到现在。......
序列比对算法在许多不同的领域得到应用。当前，一个重要的应用就是比对大分子，例如DNA和蛋白质序列比对。许多情况，有必要比对三序列......
基于典型CLUSTALW序列比对算法,研究一种局部优化的多序列比对算法,用减少序列比对过程中总评分的方法来达到优化算法的目的,并对......
按照序列的数量,先对双序列比对中Smith-Waterman算法、FASTA算法、BLAST算法、MUMmer算法和遗传算法等进行了详细分析和比较,然后......
在对序列比对结果进行分析的过程中,提出了基于生物进化思想的序列比对算法.该算法的出发点是在待比对序列中的不同位置插入空位,......
随着人类基因组计划(HGP)的开展,作为生命科学的核心学科—生物信息学也在不断的向前发展。而序列比对是生物信息学中一个非常重要......
本文在分析国内外DNA相似性比对算法研究的基础之上,重点分析基于希尔伯特空间建模方式,全文主要以数学论证和代码实现为主,并阐述......
两个或者更多DNA序列之间的比对分析是目前生物信息学关注的热点问题之一。序列比对分析是一个数据挖掘的过程,本文结合实际应用的......
