【摘 要】
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谷子(Setaria italica L.)是富含蛋白质、纤维素的主要杂粮作物之一。为了解析谷子中参与纤维素沉积和细胞扩张的COBRA家族,利用生物信息学分析手段对谷子进行全基因组鉴定和分析。结果表明,在谷子中共鉴定出9个COBRA家族成员(其中SiCOBL9序列不完整),可分为两个亚家族,来自同一亚家族的成员理化特性、序列保守性和基因结构相似,COBRA家族编码基因主要分布在染色体的两端,系统发
【机 构】
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江苏省农业科学院江苏沿海地区农业科学研究所
【基金项目】
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江苏省农业科技自主创新资金(CX(20)3138); 河北省三三三人才资助项目(A202103001); 江苏省盐土生物资源研究重点实验室开放课题(JKLBS2020006); 国家重点研发项目(2019YFD1001700)共同资助;
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谷子(Setaria italica L.)是富含蛋白质、纤维素的主要杂粮作物之一。为了解析谷子中参与纤维素沉积和细胞扩张的COBRA家族,利用生物信息学分析手段对谷子进行全基因组鉴定和分析。结果表明,在谷子中共鉴定出9个COBRA家族成员(其中SiCOBL9序列不完整),可分为两个亚家族,来自同一亚家族的成员理化特性、序列保守性和基因结构相似,COBRA家族编码基因主要分布在染色体的两端,系统发育树分析显示谷子COBRA蛋白与禾本科玉米最为相似,并且所有成员都具有COBRA蛋白所具备的CCVS保守结构和糖基化修饰位点等。组织表达模式分析结果表明,基因的表达存在组织差异性,其中SiCOBL6在所选组织中表达量均较高,并且在这所选组织中未发现特异表达的基因。
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茶叶由茶树叶片为原料,继以不同的加工方法制成。按照加工方法,茶叶一般分为绿茶,黄茶,白茶,乌龙茶,红茶和黑茶六大茶类。由于加工工艺技术不同,各类茶叶的颜色、滋味、形状等存在显著的差异。茶叶加工影响茶叶品质的实质是对茶鲜叶中化合物的种类及含量的改变,茶叶中主要化学成分包括儿茶素类、黄酮及其糖苷类、生物碱类、氨基酸类、酚酸类等物质。已有的六大茶类化学成分的比较研究较少,且以市售商品为主,茶鲜叶原料来源
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茯砖茶是一种经过“发花”工艺加工而成的黑茶。发花过程中大量微生物的参与及适度的湿热作用使茯砖茶内含成分发生变化,最终形成其特有的风味品质。目前针对茯砖茶中微生物群落的研究尚未涉及细菌和真菌群落关联分析,更没有将微生物群落的演替与茯砖茶化学成分的变化联系起来。为明确以上关系,本实验对发花过程中的茯砖茶进行多时间点取样,应用扩增子测序和液质代谢组学技术,探讨茯砖茶发花过程中微生物群落和化学成分的演替及
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