序列拼接相关论文
在现实生活中，对大型物体进行全景拍摄时，一种方法是增加拍摄物距，但获得的全景图细节信息不够丰富，并且实际拍摄场地可能会限制拍摄。......
生物信息学是一门综合利用生物学、计算机科学、数学等学科知识的新兴交叉学科，其主要任务是揭示海量生物学数据中蕴含的生物学意义......
随着EST序列数据的越来越多,来自于不同个体的大量冗余的EST将会是发掘SNP很好的资源。SNP作为第三代遗传标记,是人类可遗传变异中......
对蛋白质全序列进行测定,有助于分析蛋白质的结构,揭示蛋白质的生物学功能.针对目前基于质谱的蛋白质测序流程中使用特异性蛋白酶......
随着高通量测序技术的快速发展,出现了很多应用高通量测序数据的结构变异检测方法。由于高通量测序本身的局限性,例如片段较短、测......
没有人否认,分布式集群技术让高性能计算在不断突破峰值纪录的同时,迅速走向普通大众,上世纪80-90年代还是巴统组织的禁运技术,现......
【目的】建立快速获取55型腺病毒的全长基因组序列的方法。【方法】根据55型腺病毒的基因组特点,设计覆盖55型腺病毒基因组序列的1......
基因组序列拼接的主流方法是将整条序列随机打断成小片段,然后根据片段间重叠关系连接成长序列.由于较多噪音存在,算法复杂度高,加......
用设计的引物对胸膜肺炎放线杆菌1、3、6、9型标准株的荚膜多糖输出部分基因序列进行了扩增、克隆、测序,分别获得4个型的部分cpxD......
提出一种基于OGSA的生物计算网格体系结构,分析研究了生物应用标准化、资源描述、作业描述和作业调度等,对序列拼接应用Phrap在该......
针对目前基于测序的结构变异检测方法检测效果较差的问题,提出了基于序列拼接的长插入变异（ISALins）检测方法。首先融合3种不同检测......
本文阐述了如何在Intranet环境中设计并实现一个通用的基因测序电子克隆系统，以满足各研究院所的大规模、快速数据分析工作需要。......
在国际最大公共数据库GenBank的dbEST数据库中收录了大量各种生物的ESTs，这些大量的EST序列对发现、克隆和定位新基因，构建遗传图谱，......
目的设计一种基于高通量测序数据的功能强大、处理速度快且不依赖于运行环境的本地化的微生物检测算法。方法对微生物基因组进行分......
近几年飞速发展的高通量测序技术（next generation sequencing,NGS）在生命科学研究的各个领域充分展现了其低成本、高通量和应用面广......
有许多软件可以帮助分子生物学工作者解决一些他们日常实验室工作中遇到的问题.Vector NTI Suite是一种高度集成、功能齐全的分子......
基于SMP机群并行编程环境下,提出了一种MPI+Pthread的程序并行化模式.使用这种并行模式实现了对生物DNA序列拼接程序Phrap的并行化......
提出了一种新的测序纠错算法．该算法在对测序数据拼接之前对其进行检查，找出并修正测序序列中的错误，该算法将测序数据映射成欧拉超路......
“00后”的手游天下： 下课后想要轻松娱乐，可是又没有机会打开网游副本，如何一展我得心应手的游戏技能呢？不用多说，当然是风靡的手游......
某控制软件有加载模式和应用模式.控制终端输入命令进入加载模式选择当前软件运行在哪一个模式下.加载程序负责当前板子里运行的是......
11月2日，记者从中国农业科学院举行的新闻发布会上获悉，由我国科学家发起和主导的国际黄瓜基因组计划研究取得重大突破，通过采用新一......
提出了一种基于图划分的全基因组并行拼接算法．该算法巧妙地将数据划分问题转化成图划分的问题，解决了传统数据划分算法中存在的节点......
在已有测序数据基础上,利用三种常见的序列组装软件对Paenibacillus Shenyangensis全基因组测序结果进行拼接组装,分析比较了不同......
本论文共包括两部分工作,一部分是对枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)BSn5中新型抑菌蛋白APn5进行了鉴定及性质研究;另一部分是利......
为了充分挖掘现有的庞大EST数据资源所蕴含的生物学信息,系统的分析方法 对其研究显得尤为重要.该文参照目前广泛运用的3种EST数据......
针对DNA序列拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,通过对前期定长子串方法的改进,提出了一种基于变长子串的新算法。新算法在扫描shotg......
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新一代测序的发展和推广应用使生物序列数据增长速度远远超过了摩尔定律对计算机处理能力增长的预期。该研究人员将深入分析各种基......
<正>新一代大规模平行测序技术能以相当低的单位成本下提高测序通量,但是大量DNA小片段的拼接组装极具挑战性,如果序列拼接这个关......
生物序列拼接是鸟枪法(shotgun)测序中的一个重要环节.主要介绍了生物序列拼接及其研究中所涉及的一些基本问题,概述了两类主要的......
序列拼接是生物信息学的基础问题.全面总结了面向下一代测序技术的de novo DNA序列拼接工具,介绍下一代测序平台产生的数据特点以......
序列拼接是全基因组测序的核心问题之一.基于“overlap-layout-consensus”的传统拼接软件虽然被人们应用于人类基因组拼接等项目,......
随着遗传学研究的深入，特别是人类基因组计划完成之后，人们认识到取得各个物种的完整基因组序列对于生命本质的探索有着非常重要的作......
本文介绍DNA序列拼接的研究背景及内涵,给出两类拼接算法的基本处理过程与研究现状,分析DNA序列拼接面临的挑战和应对方法,对DNA序......
随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生。介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算......
